После каникул, ученики престижной школы «Логос» снова приступают к учебе. Но, как и прежде, главное для них – разгадка запутанной истории, которая мучает их уже давно. Игра принимает серьезный оборот . Ребята пытаются разобраться, что же за странный подвал с флагом нацистов они обнаружили в древней часовне? Тем временем, Андрей все ближе к разгадке тайны исчезновения родителей. Не все спокойно и в отношениях с друзьями, ведь на их пути теперь стоят страшные испытания : угроза смерти, болезни, предательств. Анне предстоит сделать выбор, на чьей стороне она находится, имеет ли право жить её брат, если за это она должна платить высокую цену – чужие человеческие жизни.
Максим встретится лицом к лицу с новой реальностью – оказывается, его мать, Маша была всё это время рядом с ним, а отец был убит злым любовником его любимой девушки. А его приёмный отец мало того, что издевался и обманывал его, так ещё и предал, отдав на растерзание одно сектанту.
И, конечно же, всем ребятам предстоит иметь дело с организацией фашистов, похищающих и мучающих попеременно, то детей, то взрослых. Не удивимся, если в Закрытой школе Андрей и его друзья организуют антифашистское подполье и будут действовать партизанскими методами против Войтовича и его одно партийцев.

Вадим посылает Машу на поиски Князя. Если не найдёт – он набьёт Володе не только лицо и не даст Максу вакцину. Андрей и Женя спустились в подземелье. Там Андрей встретил своего брата Игорька на руках у дяди Виктора.

Саша пал смертью храбрых, пытаясь освободить жену и детей из фашистского плена. Андрей и Женя освободили Макса и Лизу из железной клетки, где они сидели в ожидании участи, и Лиза повела Макса по следам кровавым Ингрид, а когда они вошли в комнату с хрустальным гробом, Максим разбил его.

Войтевич достал берданку из тайника в земле, а так же несколько гранат. Разбил люк и кинул гранату в комнату, где лежала готовая к переливанию крови Ингрид.

Лена смотрела на фото папы и плакала горькими слезами, а тут в комнату ворвался Паша и обнял любимую директрису школы. Володя очнулся в центре Москвы с введённой капсулой в шею, и он бредёт в сторону правительственных зданий. Верёвкин таки разбил капсулу с вирусом в школе после того, как её хорошо сотрясло после гранаты Войтевича.